Miembro del Parlamento inglés del siglo 17 que también se desempeñó como Administrador Naval Británico. Es mejor conocido por un diario históricamente significativo que mantuvo entre 1660 y 1669.
Asistió a Magdalene College, Cambridge y rápidamente ascendió entre los rangos administrativos de la marina británica.
Su famoso diario, publicado más de un siglo después de su muerte, detalla eventos del período de restauración inglés como el Gran Incendio de Londres, la Segunda Guerra Anglo-Holandesa y la Gran Plaga de Londres.
Sus 10 hermanos y él nacieron en Londres. Se casó con Elisabeth de St Michel en 1655.
Durante el reinado de Charles II de Inglaterra, Pepys se desempeñó como Secretario Jefe del Almirantazgo Real de la Marina.