Ex actor infantil que protagonizó Cuenta Conmigo y obtuvo una nominación al Óscar por su papel en Al Filo del Vacío. También interpretó al joven Indiana Jones en el éxito de taquilla de 1989 Indiana Jones y la Última Cruzada. Murió trágicamente de una sobredosis de drogas a la temprana edad de 23.
Mientras crecía, él y su familia pasaron tiempo viviendo dentro de un culto religioso llamado Los Hijos de Dios. A los diez años, comenzó a actuar en comerciales de televisión.
Su última película fue el drama Dark Blood. El rodaje no se terminó debido a su muerte y la película permaneció incompleta por 19 años antes de que fuera finalmente editada y presentada en el Festival e Cine Holandés en septiembre del 2012.
Su madre, Arlyn Sharon Phoenix, sirvió como presidente de la junta directiva del Centro River Phoenix para la Consolidación de la Paz. Sus hermanos son Rain, Joaquin, Liberty y Summer Phoenix.
Tanto él como Ethan Hawke hicieron sus debuts cinematográficos en la película de ciencia ficción Los Exploradores.