Fundador del movimiento periodista Gonzo, cuyo legado incluye el Fear and Loathing in Las Vegas y Hell's Angels: The Strange and Terrible Saga of the Outlaw Motorcycle Gangs. Se convirtió en un ícono de la contracultura por su uso de drogas, patriotismo y por su resonante voz literaria.
Se metió en muchos problemas en la escuela secundaria y fue enviado a la cárcel después de incitar a un robo. Creció leyendo Jack Kerouac y los Beats.
El también escritor y antiguo amigo, Oscar Zeta Acosta, inspiró al personaje Dr. Gonzo de Fear and Loathing en Las Vegas.
Era el hijo mayor de Virginia Ray Davison y Jack Robert Thompson, quien murió cuando Hunter era joven. Estuvo casado con Anita Thompson desde el 2003 hasta su muerte en el 2005. Tuvo un hijo llamado Juan Fitzgerald Thompson.
Era un feroz oponente vocal de Richard Nixon y solía usar una máscara de Halloween con su imagen.
